Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms