Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NME3Q13232 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NME3Q13232 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms