Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SEMA3BQ13214 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms