Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms