Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
BPTFQ12830 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BPTFQ12830 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms