Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXD10P28358 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXD10P28358 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXD10P28358 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD10P28358 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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