Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms