Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms