Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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