Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIP13Q15645 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms