Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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