Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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