Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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