Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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