Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms