Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMIEQ8NEW7 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMIEQ8NEW7 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms