Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OLFM5P-201ENST00000411807 1478 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PUDPP1-201ENST00000421058 495 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SDHAP1-203ENST00000427149 706 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPL12P14-201ENST00000431782 490 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ASS1P5-201ENST00000435496 1239 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ASH2LP1-201ENST00000438037 985 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SL724P-201ENST00000461895 271 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC018638.4-201ENST00000465971 1150 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-14-201ENST00000517571 347 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FGF12-AS1-202ENST00000530635 555 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL132639.1-201ENST00000553698 475 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL352979.1-201ENST00000554238 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC025198.1-201ENST00000578331 419 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SL693P-201ENST00000579576 279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL590705.1-201ENST00000607322 484 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC245100.4-207ENST00000640776 1082 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 HVCN1-207ENST00000548312 1301 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms