Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTF1Q16619 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms