Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms