Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms