Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CUL4AQ13619 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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