Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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