Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCOF1Q13428 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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