Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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