Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMTNP53814 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms