Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA13P31271 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA13P31271 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA13P31271 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA13P31271 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA13P31271 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA13P31271 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA13P31271 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA13P31271 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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