Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ERVV-1B6SEH8 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms