Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms