Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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