Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP3Q9Y6F1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARP3Q9Y6F1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms