Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms