Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF8Q9UPP1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms