Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD1Q9UP38 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms