Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms