Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPCN1Q9ULQ1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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