Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT7Q9UIV1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT7Q9UIV1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms