Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms