Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFMBT1Q9UHJ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms