Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DKK2Q9UBU2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms