Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
CCDC180Q9P1Z9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms