Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms