Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms