Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A4Q9NY91 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms