Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms