Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDFIP2Q9NV92 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP2Q9NV92 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms