Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPJQ9HC77 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms