Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms