Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP4Q9H6H4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms