Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF39Q9H2S5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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