Protein–RNA interactions for Protein: Q9H267

VPS33B, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33BQ9H267 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS33BQ9H267 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS33BQ9H267 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms